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QTL IciMapping集成遗传分析软件文章被引超1000次

点击数:  |  发表时间:2023-04-19

QTL IciMapping是课题组研制的首个集成遗传分析软件,适用于两个纯系亲本杂交产生的多种后代群体。该软件自2007年首次发布以来,经不断扩充和完善,目前已发布到4.2版。软件具有表型数据方差分析、SNP基因型数据转换、冗余标记删除、连锁图谱构建、图谱整合、奇异分离座位定位、QTL作图、QTL与环境互作分析、染色体片段置换系CSSL群体QTL作图、巢式关联分析NAM群体QTL作图等10大功能。软件具有界面友好、功能完善、处理数据量大、结果可靠等特点,在国内外享有盛誉,并获得广泛应用。介绍该软件的文章于2015年发表在《The Crop Journal》期刊,截至目前被引超1000次。这既是课题组所发表引用次数最高的文章,也是该期刊自发行以来所发表引用次数最高的文章。

除QTL IciMapping软件之外,课题组还研制了适用于其他类型遗传群体的集成软件。GACD (Genetic Analysis of Clonal F1 and Double Cross) 软件适宜于两个杂合亲本的杂种F1群体,以及四个纯系的双交群体。GAPL (Genetic Analysis Software of Pure-Line Populations) 软件适宜于四个至八个纯系衍生的纯系DH和RIL纯系后代群体。这两个软件与QTL IciMapping软件一起,可以对自花授粉、异化授粉和无性繁殖等不同繁殖方式物种中各种杂交后代群体开展遗传分析研究。最近还发布了GAHP (Genetic Analysis Software of Heterozygous Populations) 软件,适宜于双亲纯系衍生的纯系后代群体,以及纯系后代衍生的永久回交和永久F2,对杂种优势遗传机制的分析和研究具有重要作用。

课题组将继续对这些软件优化升级和功能强化,努力为各类遗传数据有效分析和重要性状遗传研究提供完善高效的一站式分析计算机工具。

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