GAPL是一个界面友好、能够在四交和八交衍生纯系群体中构建高密度连锁图谱、开展数量性状基因 (QTL) 定位的集成软件。软件1.2版于2018年9月发布，并于2019年7月更新。
1.2版具有以下四大功能：1、基因型芯片检测数据转换的SNP功能（将遗传群体中个体或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT数据转换为软件需要的格式，用户需要提供亲本基因型才能利用此功能）；2、删除冗余标记的BIN功能；3、四交、八交纯系群体构建连锁图谱的PLM功能；4、四交、八交纯系群体QTL作图的PLQQ功能。
此次更新内容包括：
1、PLM功能中，成对重组率矩阵保存在一个临时文件中，以提高大量标记的处理能力，面前能处理的标记数量可以达到数万个；更多标记的群体，建议先使用BIN功能去除冗余。
2、PLM功能中，对排序算法进行了优化。
3、同时提供32位和64位两种版本。
