GACD是无性系F1和双交群体的遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位集成软件,软件采用最新的编程技术,把不同功能包装在一个工程中,用户可以随时查看已经完成的各项操作,浏览已完成操作产生的各种结果,软件界面更加友好、功能更加强大。软件1.1版于2019年7月发布。
1.2版具有以下四大功能:1、基因型芯片检测数据转换的SNP功能(将遗传群体中个体或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT数据转换为软件需要的格式,用户需要提供亲本基因型才能利用此功能);2、删除冗余标记的BIN功能;3、克隆F1和双交群体构建连锁图谱的CDM功能;4、克隆F1和双交群体QTL作图的CDQ功能。
与1.1版的不同之处:
1、增加了基因型芯片检测SNP数据的转换功能,称为SNP功能,作为软件的第1个功能。该功能将遗传群体中个体或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT数据转换为软件需要的格式,用户需要提供无性系F1群体的两个杂合亲本或四交F1群体的四个纯合亲本的基因型数据才能利用此功能。
2、CDM功能中,成对重组率矩阵保存在一个临时文件中,以提高大量标记的处理能力,面前能处理的标记数量可以达到数万个;更多标记的群体,建议先使用BIN功能去除冗余。
3、CDM功能中,对排序算法进行了优化。
4、同时提供32位和64位两种版本。
