双亲永久杂合群体遗传分析集成软件GAHP
双亲永久杂合群体是重要的遗传资源,常常用于杂种优势研究。GAHP(Genetic Analysis with bi-parental immortalized Heterozygous Populations)是一个公开的永久杂合群体及其亲本纯系群体遗传分析集成软件。GAHP软件可对四种类型群体进行遗传分析。(1)双亲纯系群体PIL,纯系既可以是杂种F1配子的加倍单倍体(DH),也可以是通过连续自交产生的重组自交系(RIL);(2)PIL与第一个亲本回交产生的永久回交群体IB1;(3)PIL与第二个亲本回交产生的永久回交群体IB2;(4)PIL中两两纯系间互交产生的永久F2群体IF2。
软件1.0版本集成了四个分析平台:
(1) MHP:遗传连锁图谱绘制;
(2) VHP:双亲永久杂合群体的多元环境与表型分析;
(3) QHP:双亲永久杂合群体的QTL定位;
(4) SHP:双亲永久杂合群体的模拟。
软件发布于2022年6月27日,并于2022年11月1日更新。