第十八届 “基因定位与育种设计”研讨会专题

应我所广大科研人员和研究生的要求，数量遗传课题组将在作科所内部举办一期“基因定位与育种设计”培训。内容包括遗传群体及其构建、表型数据分析和遗传力估计、群体和数量遗传基础、标记间重组率估计和连锁图谱构建、不同群体连锁图谱的整合、基因定位原理和方法、关联分析原理和方法、无性系和多亲群体的遗传分析方法、全基因组选择方法等，详细日程和回执附后。

参加人员为作科所遗传育种领域的科研人员和研究生，具备遗传学、育种学、生物统计和计算机等方面的基本知识；自带安装有Windows操作系统的笔记本电脑，鼓励携带自己的遗传群体或育种数据参会；提供简单的工作午餐，不收取培训费。本次培训班由2015年农科院科技创新工程-作物生物信息学及应用团队经费赞助。

时间：2015年8月24 - 28日

地点：中国农业科学院作物科学研究所育种楼718会议室

规模：50人左右（报名截止时间为2015年8月10日；场地所限，超过50人时，按报名先后顺序参加）

联系人：钱亚红（qianyahong@caas.cn; 86 10 82106038; 18001126271）

详细日程
作息时间：上午9:00~12:30上课、12:30~13:30午餐、下午13:30~17:00上课
8月24日上午：以群体和数量遗传学为主，内容包括群体结构估计，影响群体结构的因素，表型数据方差分析和广义遗传力估计，遗传效应和遗传方差的分解，亲属间的遗传相关和遗传交配设计，狭义遗传力估计，遗传进度估计，相关遗传进度，选择指数等；利用Excel进行简单的统计和遗传分析等内容。
8月24日下午：以两点连锁分析和QTL IciMapping软件为主，内容包括遗传学基本规律，不同类型双亲群体的遗传结构，两个连锁座位之间的重组率估计；连锁图谱构建和QTL做图集成软件QTL IciMapping功能介绍；利用QTL IciMapping软件绘制连锁图谱（MapShow）、估计两个座位间的重组率（2pointREC）、开展多环境表型鉴定数据方差分析（ANOVA）、利用表型数据估计性状的广义遗传力（ANOVA）。
8月25日上午：以三点连锁分析和图谱构建为主，内容包括三个座位间的遗传干涉和遗传图距，标记分群和排序，遗传图谱与物理图谱的关系，利用QTL IciMapping软件去除冗余标记（BIN）、构建连锁图谱（MAP）、整合多条连锁图谱等内容（CMP）。
8月25日下午：以加显性QTL作图为主，内容包括QTL作图的基本原理，单标记QTL作图方法，简单区间作图方法，利用QTL IciMapping软件开展单标记QTL作图（BIP）、简单区间作图（BIP）。
8月26日上午：以加显性QTL作图为主，内容包括背景遗传变异控制的重要性，完备区间作图原理和方法，QTL作图中的两类错误，不同QTL作图方法的比较，利用QTL IciMapping软件开展完备区间作图（BIP）、模拟遗传群体（BIP）、比较不同方法的QTL检测功效（BIP）等内容。
8月26日下午：以互作QTL作图和染色体片段置换系群体为主，内容包括上位型互作QTL作图，QTL与环境的互作分析，选择基因型分析，混合分离分析，染色体片段置换系群体的QTL作图，巢式关联群体的QTL作图，利用QTL IciMapping软件开展互作QTL作图（BIP）、QTL与环境互作分析（MET）、染色体片段置换系群体QTL作图（CSL）、巢式关联群体QTL作图（NAM）。
8月27日上午：以关联分析方法为主，内容包括连锁不平衡的定义和计算，群体结构对连锁不平衡的影响，随机交配对连锁不平衡的影响，常见关联分析方法；QTL作图常见问题解析；利用Tassel软件开展关联分析。
8月27日下午：以多亲群体和无性系物种的遗传分析方法为主，内容包括无性系遗传群体的连锁分析、连锁图谱构建和基因定位方法，双交群体的连锁分析、连锁图谱构建和基因定位方法，连锁图谱构建和QTL做图集成软件GACD的功能介绍和使用（BIN、CDM、CDQ）。
8月28日上午：以育种模拟和育种设计为主，内容数量遗传的育种应用，植物育种过程的建模和模拟，不同育种方法的模拟比较，已知基因信息的育种设计，利用QUGENE和QuLine软件模拟育种过程等内容。
8月28日下午：利用自己的群体和数据开展遗传分析；自由讨论和交流，包括对培训班的意见和建议，研究过程中遇到的遗传学和统计学问题等。